Apologize kelimesi, 'özür dilemek' anlamına gelir. Bu şarkının ana teması ve başlığıdır, bu yüzden şarkının mesajını anlamak için kilit bir kelimedir.
Şarkıda, kahraman kendisine yapılan haksızlığa rağmen, artık özür dilemenin çok geç olduğunu ve ilişkinin geri dönülmez bir noktaya geldiğini ifade ediyor. Bu kelime, pişmanlık ve affetme temalarını güçlü bir şekilde vurgular.
Amerikalı prodüktör Timbaland ve OneRepublic'in bu ortak işinde, ipleri tamamen koparan sert bir yüzleşme var. Şarkı doğrudan tehlikeli bir iple açılıyor: "I'm holding on your rope / Got me ten feet off the ground" (Senin ipine tutunuyorum / Yerden üç metre havadayım). Karşı taraf onu havada asılı bırakmış, sonra da kesip yere düşürmüş: "You tell me that you need me / Then you go and cut me down" (Bana ihtiyacın olduğunu söylüyorsun / Sonra gidip beni yere seriyorsun). Buradaki "cut someone down" deyimi hem fiziksel olarak o ipi kesip düşürmeyi hem de birini acımasızca kırmayı, küçük düşürmeyi anlatıyor.
Sonra o ünlü nakarat geliyor. Karşı taraf af diliyor ama artık nafile: "It's too late to apologize" (Özür dilemek için çok geç). Anlatıcı vaktiyle onun için kurşunun önüne atlayacağını söylüyor: "take a shot for you" (senin için vurulmayı göze alırdım). Hatta aşkını alev rengiyle tarif ediyor: "I loved you with a fire red, now it's turning blue" (Seni ateş kırmızısıyla sevdim, şimdi maviye dönüyor). Ateş soğuyor, geriye sadece kapıyı yüzüne kapatan o net ve tavizsiz söz kalıyor.