Anointed bedeutet wörtlich "gesalbt" und wird oft im religiösen Kontext verwendet, um die Weihe oder Segnung einer Person zu beschreiben.
In diesem Lied wird es metaphorisch genutzt: "That you anointed with your heart" bedeutet, dass die geliebte Person dem Sänger ihr Herz mit einer Art heiliger Hingabe geschenkt hat. Es ist ein ungewöhnliches und starkes Wort in einem Popsong, das die Tiefe und Ernsthaftigkeit der Gefühle unterstreicht, die der Sänger missbraucht hat.
In „Gotta Be You“ singt One Direction über eine Person, die einen großen Fehler gemacht hat und nun um Vergebung bittet. Der Sänger sieht die Enttäuschung in den Augen seiner Liebsten („Girl I see it in your eyes you're disappointed“) und erkennt, dass er ihr Herz gebrochen hat („I tore it apart“). Er gibt zu, der „törichte Narr“ zu sein, der ein „Chaos“ in ihrem Leben angerichtet hat, und er weiß, dass keine Frau das verdient. Es ist ein ehrliches Eingeständnis von Schuld und Reue.
Der Refrain ist ein verzweifelter Appell: „It's gotta be you / Only you“ („Du musst es sein / Nur du“). Diese Zeile wird immer wieder wiederholt und unterstreicht die Kernbotschaft des Liedes. Der Sänger hat Angst, dass seine Partnerin ihn verlässt, und er glaubt, dass er ohne sie „verblassen“ würde („I know I'll fade“). Er bittet um eine weitere Chance, verspricht, an ihrer Seite zu bleiben und alles besser zu machen.